工程技术研究院还承担了科研任务和研究生培养任务，科研课题集中在污水生化处理工艺和深度处理研究、固体废弃物热处理工艺研究和资源化研究。自团队组建以来，团队共接收硕士研究生28人，本科毕设2人，其中在读硕士研究生17人，已有13人顺利完成学业，走上工作岗位，为美丽中国建设贡献微薄之力。
1）亚硝化-厌氧氨氧化工艺
针对高氨氮废水，采用亚硝化与厌氧氨氧化工艺的组合，降低出水的硝酸盐。废水中的氨氮经氨氧化细菌的处理后部分转化为亚硝酸氮，已转化为亚硝酸氮的废水和未转化的氨氮废水的混合液经厌氧氨氧化细菌的处理，转化为氮气排放至大气中，降低出水中的硝酸氮，控制出水的总氮。出水采用膜分离，能够迅速提升生物池中的微生物浓度，缩短系统启动时间，保障出水悬浮物浓度。
亚硝化-厌氧氨氧化组合工艺流程 
高氨氮废水处理工艺现场
2）常温催化还原脱氮技术
污水经生化、深度处理后，一般来说，各项指标均能满足其最低排放要求。为了能够达到地表水水质的排放要求，控制总氮含量，工程技术研究院研究发现，在催化剂作用下，硝酸氮能够被强还原性物质（如H2、硼氢化物等）转化为氮气。
3）含硫固废循环经济研究
电厂排放的尾气中含二氧化硫，经水洗后产生的大量的固废亚硫酸钙和硫酸钙；化工企业产品合成排放的高浓度硫酸废水，中和后产生也会产生固废硫酸钙。处置这些固体废弃物成本较高，对土壤和水体等生态环境造成严重破坏，因此，工程技术研究院采用高温热还原处理的方式，循环利用含硫废物，并且部分资源化，降低企业的处置成本，提高经济效益。
硫酸钙热还原技术工艺流程
4）生物质焦油资源化利用技术
在生物质制油或制气过程中，产生的焦油量非常大，其中含多种挥发性和芳香烃类物质，散发的气味严重污染周边环境。因此，如何处置这些焦油成为影响生物质资源化利用的制约条件。工程研究院凭借在处理高浓度有机废液过程中积累的经验，利用浓硫酸的强脱水性，在一定温度、压力条件下，能够按照水的氢氧原子组成比（2:1）脱去焦油中的氢氧元素，从而达到脱水炭化的效果，得到高品质新产品。
焦油炭化小试装置
初分产品